Ως αντίδραση στην προέλαση των Ελλήνων Κρητών, ο πασάς των Χανίων διέταξε τον άμεσο εξοπλισμό των Μουσουλμάνων της πόλεως (17 Ιουνίου 1821) και εξέδωσε ορισμό για γενική σφαγή όλων των Χριστιανών, ενώ στα τζαμιά των Χανίων αναγνώσθηκε ο συναφής φετφάς. Αμέσως ο Μουσουλμανικός όχλος προέβη σε σφαγές και λεηλασίες εναντίον των Χριστιανών τής πόλεως. Την επόμενη μέρα (18 Ιουνίου) ο μαινόμενος ένοπλος όχλος εξήλθε της πόλεως των Χανίων και συνέχισε επί μέρες, μέχρι το τέλος τού Ιουνίου 1821, τις ωμότητες και καταστροφές σε δεκάδες χωριά και αρκετά μοναστήρια της περιοχής.